Navigation

Adresse : Laboratoire Génome et Développement des Plantes, UMR 5096 CNRSUPVD, Université de Perpignan Via Domitia, 52, avenue Paul Alduy, 66860 Perpignan cedex

Composition :
Richard COOKE (DR2 CNRS)
Eric LASSERRE (MCU Perpignan)
Olivier PANAUD (PR Perpignan)
Nathalie PICAULT (MCU Perpignan)
Cristian CHAPARRO (IE CNRS)
Chrystel LLAURO-BERGER (AI CNRS)

Activité scientifique : Les activités de recherche du groupe portent principalement sur la structure, l'évolution et la fonction des génomes d'espèces sauvages et cultivées du genre Oryza (riz), en particulier l'impact des éléments transposables (ET) et de la duplication du génome.
Nos études antérieures sur les rétrotransposons à LTR, nous ont conduit à proposer un modèle pour l'évolution des génomes des plantes (Vitte et Panaud, 2005) dans lequel deux forces contraires, l'expansion par la rétrotransposition (Piegu et al., 2006) et la contraction par recombinaison ou par la délétion (Vitte et al., 2007 ; Vitte and Panaud, 2003), sont responsables de la variation de la taille du génome. Nous avons participé à l'annotation de rétrotransposons à LTR dans le génome du riz dans le "Rice Annotation Project" (RAP3) et nous avons créé une base de données rétrotransposons à LTR pour le riz, disponible à www.retroryza.org (Chaparro et al., 2007). Notre projets actuels portent sur des études fonctionnelles des TE dans le génome du riz et sur l'utilisation des techniques de séquençage de nouvelle génération suivante afin de comprendre la dynamique du génome à court terme par analyse de la mobilité des TE chez le riz (Sabot, Picault, et al., 2011).


Team leader