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Adresse : Unité de Recherches en Génomique-Info (UR INRA 1164), INRA, Centre de recherche de Versailles, bat.18, RD10, Route de Saint Cyr, 78026 Versailles Cedex, FRANCE

Composition :
Françoise Alfama-Depauw (AI INRA)
Joelle Amsellem (IE2 INRA)
Nathalie Choisne (IR1 INRA)
Claire Guerche (IE2 INRA)
Olivier Inizan (IE2 INRA)
Véronique Jamilloux (IE2 INRA)
Nicolas Lapalu (IE2 INRA)
Mikaël Loaec (IE2 INRA)
Isabelle Luyten (IE2 INRA)
Florian Maumus (CR2 INRA)
Hadi Quesneville (DR1 INRA)

Activité scientifique : Notre travail de recherche s’oriente principalement sur l’analyse de la structure, la dynamique et l’évolution des génomes eucaryotes. Nous cherchons à comprendre les forces qui modèlent la structure et le fonctionnement épigénétique des génomes. Les éléments transposables (ET) en sont un des acteurs majeurs, et nous étudions de manière approfondie leur dynamique. Pour réaliser ce travail, nous développons de nouveaux outils bioinformatiques. Ainsi, nous développons depuis plusieurs années, une boite à outil nommé REPET qui regroupe autour de bibliothèques logicielles communes, des outils d’analyses de séquences et de coordonnées génomiques, et deux « pipelines » (enchainements automatiques de logiciels) pour la découverte d’éléments transposables et leur annotation dans les génomes eucaryotes.


Team leader